Die Evangelische Kirchengemeinde Mühlhausen in Thüringen ist eine Gemeinde mit sechs Kirchen, drei Pfarrern, einer Gemeindepädagogin, einem Mitarbeiter in der Jugendkirche, einem Kirchenmusiker sowie einer Krankenhausseelsorgerin und vielen Ehrenamtlichen.
Zur Gemeinde gehören etwas mehr als 4.000 Gemeindeglieder. In der Gemeinde gibt es eine Jugendkirche, in der Jugendliche die Gottesdienste gestalten. Darüber hinaus ist ein Schwerpunkt die Kirchenmusik. An der Divi-Blasii-Kirche wirkten Kirchenlieddichter und Organisten, die Mühlhausen zu einem bedeutenden Ort der evangelischen Kirchenmusik machten. Johann Sebastian Bach war 1707/1708 an der Blasii-Kirche als Organist angestellt. Nach seiner Orgeldisposition wurde die heutige Schuke-Orgel in der Divi Blasii Kirche gebaut.